質問
ImageMagick 6.3.3で変換したPDFをField Reports のレンダリングパラメータとして渡した際、挿入したPDFが枠の大きさより小さくなってしまいます。
ただし、ImageMagick 6.8.0で変換したPDFの場合は正常に挿入されます。
回答
ImageMagick6.3.3で作成したPDFと6.8.0で作成したPDFを比較すると，用紙サイズを規定する部分に違いが見られます。
ImageMagick6.3.3で作成したPDF:
/MediaBox [0 0 600 600]
/CropBox [0 0 72 72]
ImageMagick6.8.0で作成したPDF:
/MediaBox [0 0 72 72]
/CropBox [0 0 72 72]
PDFの仕様では，MediaBoxは用紙のサイズ，CropBoxはトリミングサイズを示します。
Field Reportsの仕様では，PDFのMediaBoxにもとづいて枠に収まるように縮小拡大をしていますので，6.3.3.で作成したPDFではサイズが小さくなってしまったと思われます。
Adobe Reader等のPDFビューアではCropBoxを使用しているのでどちらも同じように見えますが，Field ReportsではMediaBoxを使用しているので縮小率に差が出ています。
ImageMagick6.8.0をお使いいただくか，出力形式をPNGやBMPなどに変えてご使用ください。